Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y1

FBXW8, F-box/WD repeat-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW8Q8N3Y1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXW8Q8N3Y1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms