Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSIG10Q8N0Z9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSIG10Q8N0Z9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms