Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNTD2Q8IXW0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms