Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP54Q7Z3B4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms