Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF550Q7Z398 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF550Q7Z398 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms