Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP1Q702N8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
XIRP1Q702N8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
XIRP1Q702N8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XIRP1Q702N8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.57■■■□□ 2
XIRP1Q702N8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
XIRP1Q702N8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms