Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZRN4Q6ZMN7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN4Q6ZMN7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms