Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
VSTM1Q6UX27 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM1Q6UX27 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms