Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms