Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM88Q6PEY1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms