Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT80Q6KB66 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT80Q6KB66 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms