Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN12LQ6IEE8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN12LQ6IEE8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLFN12LQ6IEE8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms