Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF123Q5XPI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms