Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATAD3BQ5T9A4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATAD3BQ5T9A4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms