Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms