Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD12Q587J7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms