Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDCCQ504Y2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms