Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf46Q504U0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms