Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CRY2Q49AN0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY2Q49AN0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms