Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms