Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL38Q2WGJ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL38Q2WGJ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms