Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCK2Q16822 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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