Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms