Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA6Q15825 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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