Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIBQ15653 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKBIBQ15653 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIBQ15653 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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