Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMGN3Q15651 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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