Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SEC23BQ15437 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SEC23BQ15437 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SEC23BQ15437 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SEC23BQ15437 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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