Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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