Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms