Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
R3HDM1Q15032 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms