Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms