Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTCH1Q13635 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCH1Q13635 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCH1Q13635 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
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