Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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