Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NEUROD1Q13562 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
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