Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCGQ13326 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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