Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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