Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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