Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms