Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms