Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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NPRL3Q12980 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NPRL3Q12980 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NPRL3Q12980 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NPRL3Q12980 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPRL3Q12980 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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