Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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TP53BP1Q12888 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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TP53BP1Q12888 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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TP53BP1Q12888 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
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TP53BP1Q12888 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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