Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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