Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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