Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms