Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXM1Q08050 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXM1Q08050 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms