Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms