Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYP4A11Q02928 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms