Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms