Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms