Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms